Los chamanes son individuos extraordinarios con la capacidad de comunicarse con fantasmas, espíritus y dioses, que son invisibles para la gente común. La Shaman Fight, un prestigioso torneo que enfrenta a chamanes de todo el mundo entre sí, se lleva a cabo cada quinientos años, donde el ganador es coronado como Shaman King. Este título permite al titular actual invocar al Gran Espíritu y dar forma al mundo como mejor le parezca.
Al llegar tarde a clase una noche, Manta Oyamada, un estudiante de secundaria normal, decide tomar un atajo por el cementerio local. Al darse cuenta de él, un niño solitario sentado en una lápida invita a Manta a mirar las estrellas con “ellos”. Al darse cuenta de que “ellos” se refiere al niño y sus amigos fantasmales, Manta huye del terror. Más tarde, el niño se presenta como You Asakura, un chamán en entrenamiento, y demuestra sus poderes al unirse con el fantasma del samurái Amidamaru, de seiscientos años, para salvar a Manta de un grupo de matones. Te haces amigo de Manta debido a su habilidad para ver espíritus, y con la ayuda de Amidamaru, se propusieron lograr el objetivo de You de convertirse en el próximo Rey Chamán.
