El solitario estudiante de secundaria, Yukiteru Amano, pasa sus días escribiendo un diario en su teléfono celular, mientras conversa con sus dos amigos aparentemente imaginarios Deus Ex Machina, que es el dios del tiempo y el espacio, y Murmur, el sirviente del dios. Revelando que es una entidad real, Deus le otorga a Yukiteru un “Diario aleatorio”, que muestra entradas muy descriptivas basadas en el futuro y lo obliga a una batalla real sangrienta con otros 11 poseedores de diarios futuros igualmente poderosos.
Con la última persona en pie designada como el nuevo dios del tiempo y el espacio, Yukiteru debe encontrar y matar a los otros 11 para sobrevivir. Él se une a regañadientes con su acosador obsesivo Yuno Gasai (que también posee ese diario), y ella se encarga de garantizar su seguridad. Pero hay más en la chica de lo que parece, ya que podría tener otros planes para su amor no correspondido …