Yuuta Okkotsu está embrujado. Desde que su amiga de la infancia, Rika, murió en un accidente de tráfico, su fantasma se ha quedado con él. Pero su espíritu no aparece como la dulce niña que Yuuta conoció una vez. En cambio, ella se manifiesta como una entidad monstruosa y poderosa que lo protege ferozmente. Incapaz de controlar el comportamiento violento de Rika, Yuuta no puede hacer nada para detener el derramamiento de sangre que sigue a su brutal venganza. Como resultado, cuando es aprehendido por hechiceros “Jujutsu”, los guardianes secretos del mundo, entrenados para combatir fuerzas como Rika, Yuuta desea estar completamente aislado para que nadie más pueda resultar herido.
Sin embargo, su capturador, el maestro hechicero Satoru Gojou, tiene diferentes planes para él: se unirá a la escuela secundaria Jujutsu y aprenderá a controlar a Rika para ayudar a la gente. Ahora, un estudiante de primer año en esta escuela, Yuuta comienza a aprender artes de Jujutsu y a combatir seres malignos. Junto a sus nuevos compañeros de clase Maki Zenin, un experto en armas Jujutsu; Toge Inumaki, un hechicero que usa sus palabras como armas; y Panda, un oso panda que aparentemente camina y habla, Yuuta comienza a encontrar su lugar en el mundo y, por una vez, a sentirse cómodo con sus habilidades. Sin embargo, a medida que avanza su entrenamiento, Yuuta llega a aprender que los peligros del mundo de Jujutsu van mucho más allá de los espíritus malvados.